Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDAP32320 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDAP32320 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDAP32320 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDAP32320 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDAP32320 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDAP32320 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDAP32320 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDAP32320 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDAP32320 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDAP32320 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDAP32320 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDAP32320 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDAP32320 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDAP32320 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDAP32320 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDAP32320 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDAP32320 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDAP32320 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDAP32320 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDAP32320 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDAP32320 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDAP32320 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDAP32320 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDAP32320 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDAP32320 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDAP32320 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDAP32320 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDAP32320 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms