Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPP30301 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPP30301 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPP30301 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPP30301 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPP30301 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIPP30301 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIPP30301 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIPP30301 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPP30301 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPP30301 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPP30301 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPP30301 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPP30301 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPP30301 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIPP30301 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIPP30301 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIPP30301 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIPP30301 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIPP30301 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIPP30301 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIPP30301 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIPP30301 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIPP30301 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIPP30301 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIPP30301 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIPP30301 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIPP30301 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIPP30301 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIPP30301 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIPP30301 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIPP30301 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIPP30301 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIPP30301 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MIPP30301 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIPP30301 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIPP30301 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIPP30301 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIPP30301 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIPP30301 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIPP30301 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIPP30301 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIPP30301 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MIPP30301 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIPP30301 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIPP30301 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIPP30301 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIPP30301 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIPP30301 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIPP30301 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIPP30301 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIPP30301 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MIPP30301 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIPP30301 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIPP30301 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIPP30301 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms