Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF8P28908 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 918 ms