Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
PTPRMP28827 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRMP28827 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRMP28827 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
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