Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN3P26045 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN3P26045 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms