Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCSHP23434 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCSHP23434 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCSHP23434 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCSHP23434 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCSHP23434 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCSHP23434 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCSHP23434 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCSHP23434 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCSHP23434 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCSHP23434 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCSHP23434 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCSHP23434 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCSHP23434 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCSHP23434 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCSHP23434 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCSHP23434 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCSHP23434 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCSHP23434 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms