Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGS1P23219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTGS1P23219 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGS1P23219 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms