Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN1P21941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN1P21941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN1P21941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN1P21941 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN1P21941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN1P21941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN1P21941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN1P21941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN1P21941 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN1P21941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN1P21941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN1P21941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN1P21941 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN1P21941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN1P21941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN1P21941 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN1P21941 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN1P21941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN1P21941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN1P21941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN1P21941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN1P21941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN1P21941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN1P21941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN1P21941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN1P21941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN1P21941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms