Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKB1P19838 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB1P19838 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKB1P19838 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms