Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC1P18887 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC1P18887 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms