Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF3P18847 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATF3P18847 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATF3P18847 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATF3P18847 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATF3P18847 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATF3P18847 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATF3P18847 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ATF3P18847 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATF3P18847 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATF3P18847 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATF3P18847 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATF3P18847 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATF3P18847 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATF3P18847 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATF3P18847 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATF3P18847 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATF3P18847 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ATF3P18847 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATF3P18847 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATF3P18847 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ATF3P18847 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATF3P18847 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATF3P18847 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATF3P18847 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATF3P18847 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATF3P18847 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATF3P18847 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATF3P18847 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATF3P18847 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATF3P18847 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATF3P18847 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ATF3P18847 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATF3P18847 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATF3P18847 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATF3P18847 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATF3P18847 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATF3P18847 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATF3P18847 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATF3P18847 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ATF3P18847 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATF3P18847 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ATF3P18847 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATF3P18847 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATF3P18847 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATF3P18847 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATF3P18847 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATF3P18847 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATF3P18847 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms