Protein–RNA interactions for Protein: P18507

GABRG2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG2P18507 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG2P18507 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRG2P18507 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRG2P18507 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms