Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA4P13612 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA4P13612 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA4P13612 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms