Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR2C1P13056 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2C1P13056 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms