Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK4P11802 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK4P11802 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK4P11802 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK4P11802 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK4P11802 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK4P11802 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK4P11802 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK4P11802 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK4P11802 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK4P11802 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK4P11802 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK4P11802 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK4P11802 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK4P11802 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK4P11802 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK4P11802 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK4P11802 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK4P11802 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK4P11802 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK4P11802 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK4P11802 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK4P11802 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK4P11802 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK4P11802 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK4P11802 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK4P11802 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK4P11802 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK4P11802 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms