Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6DP0CG33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6DP0CG33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6DP0CG33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6DP0CG33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6DP0CG33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6DP0CG33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6DP0CG33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms