Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBBP07437 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBBP07437 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBBP07437 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBBP07437 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBBP07437 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBBP07437 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBBP07437 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBBP07437 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBBP07437 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBBP07437 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBBP07437 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBBP07437 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBBP07437 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBBP07437 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBBP07437 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBBP07437 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBBP07437 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBBP07437 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBBP07437 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBBP07437 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBBP07437 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBBP07437 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBBP07437 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBBP07437 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBBP07437 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBBP07437 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBBP07437 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBBP07437 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBBP07437 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBBP07437 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBBP07437 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBBP07437 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBBP07437 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBBP07437 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBBP07437 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBBP07437 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBBP07437 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBBP07437 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBBP07437 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBBP07437 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBBP07437 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBBP07437 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms