Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPBP07199 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPBP07199 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPBP07199 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPBP07199 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPBP07199 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPBP07199 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPBP07199 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CENPBP07199 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPBP07199 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPBP07199 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPBP07199 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPBP07199 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPBP07199 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPBP07199 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPBP07199 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPBP07199 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPBP07199 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPBP07199 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPBP07199 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPBP07199 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CENPBP07199 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPBP07199 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPBP07199 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPBP07199 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPBP07199 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPBP07199 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CENPBP07199 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPBP07199 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPBP07199 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPBP07199 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPBP07199 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPBP07199 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPBP07199 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPBP07199 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPBP07199 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPBP07199 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPBP07199 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPBP07199 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPBP07199 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPBP07199 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPBP07199 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPBP07199 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPBP07199 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPBP07199 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPBP07199 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPBP07199 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPBP07199 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPBP07199 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPBP07199 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPBP07199 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPBP07199 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CENPBP07199 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CENPBP07199 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CENPBP07199 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CENPBP07199 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CENPBP07199 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CENPBP07199 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CENPBP07199 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CENPBP07199 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CENPBP07199 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPBP07199 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPBP07199 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPBP07199 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPBP07199 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CENPBP07199 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CENPBP07199 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CENPBP07199 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CENPBP07199 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CENPBP07199 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CENPBP07199 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CENPBP07199 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CENPBP07199 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms