Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLBP06746 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLBP06746 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLBP06746 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLBP06746 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLBP06746 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLBP06746 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLBP06746 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLBP06746 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLBP06746 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLBP06746 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLBP06746 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLBP06746 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLBP06746 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLBP06746 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLBP06746 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLBP06746 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLBP06746 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLBP06746 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLBP06746 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLBP06746 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLBP06746 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLBP06746 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLBP06746 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLBP06746 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLBP06746 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLBP06746 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLBP06746 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLBP06746 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLBP06746 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLBP06746 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLBP06746 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLBP06746 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLBP06746 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLBP06746 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLBP06746 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLBP06746 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLBP06746 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLBP06746 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLBP06746 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLBP06746 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms