Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCKP06239 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCKP06239 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCKP06239 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCKP06239 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCKP06239 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCKP06239 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCKP06239 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCKP06239 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCKP06239 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCKP06239 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCKP06239 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCKP06239 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCKP06239 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCKP06239 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCKP06239 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCKP06239 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCKP06239 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCKP06239 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCKP06239 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCKP06239 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCKP06239 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCKP06239 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCKP06239 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms