Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALB1P05937 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB1P05937 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB1P05937 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB1P05937 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALB1P05937 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALB1P05937 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB1P05937 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB1P05937 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB1P05937 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALB1P05937 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALB1P05937 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALB1P05937 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALB1P05937 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALB1P05937 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB1P05937 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB1P05937 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB1P05937 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALB1P05937 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB1P05937 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALB1P05937 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB1P05937 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB1P05937 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALB1P05937 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALB1P05937 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALB1P05937 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALB1P05937 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB1P05937 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALB1P05937 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALB1P05937 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALB1P05937 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALB1P05937 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms