Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNB1P01574 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNB1P01574 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNB1P01574 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNB1P01574 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms