Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP5O95183 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP5O95183 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP5O95183 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms