Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX2-2O95096 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX2-2O95096 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-2O95096 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms