Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHOBTB3O94955 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHOBTB3O94955 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms