Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT38O76015 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT38O76015 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT38O76015 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT38O76015 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT38O76015 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT38O76015 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT38O76015 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT38O76015 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT38O76015 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT38O76015 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT38O76015 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT38O76015 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT38O76015 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT38O76015 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT38O76015 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT38O76015 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT38O76015 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT38O76015 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT38O76015 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT38O76015 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT38O76015 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT38O76015 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT38O76015 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT38O76015 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT38O76015 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT38O76015 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms