Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN15O75808 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN15O75808 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms