Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM3O75607 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM3O75607 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM3O75607 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM3O75607 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM3O75607 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM3O75607 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM3O75607 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM3O75607 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM3O75607 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM3O75607 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM3O75607 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM3O75607 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM3O75607 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM3O75607 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM3O75607 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM3O75607 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM3O75607 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM3O75607 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM3O75607 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM3O75607 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM3O75607 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM3O75607 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM3O75607 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM3O75607 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM3O75607 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM3O75607 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM3O75607 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM3O75607 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM3O75607 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPM3O75607 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPM3O75607 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPM3O75607 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM3O75607 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPM3O75607 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM3O75607 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM3O75607 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM3O75607 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM3O75607 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPM3O75607 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPM3O75607 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPM3O75607 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM3O75607 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM3O75607 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM3O75607 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM3O75607 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPM3O75607 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM3O75607 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms