Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F6O75461 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F6O75461 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F6O75461 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F6O75461 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F6O75461 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F6O75461 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F6O75461 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F6O75461 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F6O75461 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F6O75461 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F6O75461 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F6O75461 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F6O75461 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F6O75461 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F6O75461 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F6O75461 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F6O75461 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms