Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIPSNAP2O75323 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPSNAP2O75323 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPSNAP2O75323 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms