Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC49.64■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC49.64■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
ABCC9O60706 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC49.53■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC49.51■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC49.51■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
ABCC9O60706 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
ABCC9O60706 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.44■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC49.44■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC49.42■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC49.4■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC49.38■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
ABCC9O60706 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC49.37■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC49.36■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC49.34■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
ABCC9O60706 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
ABCC9O60706 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms