Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PEX10O60683 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX10O60683 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX10O60683 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX10O60683 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX10O60683 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PEX10O60683 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX10O60683 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PEX10O60683 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PEX10O60683 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PEX10O60683 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PEX10O60683 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PEX10O60683 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PEX10O60683 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PEX10O60683 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX10O60683 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX10O60683 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX10O60683 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX10O60683 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX10O60683 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX10O60683 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX10O60683 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX10O60683 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX10O60683 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX10O60683 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PEX10O60683 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PEX10O60683 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PEX10O60683 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PEX10O60683 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PEX10O60683 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PEX10O60683 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PEX10O60683 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX10O60683 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX10O60683 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX10O60683 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX10O60683 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX10O60683 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX10O60683 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX10O60683 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX10O60683 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PEX10O60683 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PEX10O60683 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PEX10O60683 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PEX10O60683 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PEX10O60683 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PEX10O60683 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PEX10O60683 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX10O60683 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX10O60683 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX10O60683 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX10O60683 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX10O60683 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX10O60683 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX10O60683 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX10O60683 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX10O60683 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX10O60683 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX10O60683 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX10O60683 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX10O60683 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX10O60683 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX10O60683 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX10O60683 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms