Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP104O60308 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP104O60308 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP104O60308 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP104O60308 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP104O60308 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP104O60308 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP104O60308 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP104O60308 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP104O60308 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP104O60308 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP104O60308 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP104O60308 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP104O60308 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP104O60308 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP104O60308 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP104O60308 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP104O60308 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP104O60308 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP104O60308 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP104O60308 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP104O60308 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP104O60308 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP104O60308 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP104O60308 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP104O60308 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP104O60308 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP104O60308 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP104O60308 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP104O60308 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP104O60308 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP104O60308 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP104O60308 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP104O60308 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP104O60308 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP104O60308 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms