Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LANCL1O43813 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LANCL1O43813 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LANCL1O43813 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms