Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOPO43791 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOPO43791 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOPO43791 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOPO43791 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOPO43791 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOPO43791 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOPO43791 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOPO43791 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOPO43791 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPOPO43791 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPOPO43791 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOPO43791 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOPO43791 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOPO43791 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOPO43791 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOPO43791 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOPO43791 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOPO43791 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOPO43791 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOPO43791 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOPO43791 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPOPO43791 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPOPO43791 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPOPO43791 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPOPO43791 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPOPO43791 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPOPO43791 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPOPO43791 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPOPO43791 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPOPO43791 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPOPO43791 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPOPO43791 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPOPO43791 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPOPO43791 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPOPO43791 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPOPO43791 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPOPO43791 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPOPO43791 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPOPO43791 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms