Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN4O43707 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN4O43707 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN4O43707 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms