Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROM1O43490 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROM1O43490 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROM1O43490 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROM1O43490 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROM1O43490 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROM1O43490 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROM1O43490 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROM1O43490 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROM1O43490 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROM1O43490 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROM1O43490 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROM1O43490 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROM1O43490 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROM1O43490 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROM1O43490 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROM1O43490 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROM1O43490 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PROM1O43490 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROM1O43490 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROM1O43490 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROM1O43490 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROM1O43490 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROM1O43490 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROM1O43490 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROM1O43490 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM1O43490 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM1O43490 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM1O43490 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROM1O43490 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROM1O43490 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM1O43490 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM1O43490 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM1O43490 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM1O43490 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM1O43490 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM1O43490 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms