Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD3O43242 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD3O43242 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms