Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRXO43186 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRXO43186 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRXO43186 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRXO43186 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRXO43186 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRXO43186 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRXO43186 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRXO43186 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRXO43186 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRXO43186 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRXO43186 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRXO43186 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRXO43186 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRXO43186 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRXO43186 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CRXO43186 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms