Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP290O15078 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP290O15078 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms