Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2A1O14983 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A1O14983 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A1O14983 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms