Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC80O14777 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC80O14777 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDC80O14777 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDC80O14777 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDC80O14777 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDC80O14777 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDC80O14777 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC80O14777 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC80O14777 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC80O14777 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC80O14777 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC80O14777 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC80O14777 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC80O14777 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC80O14777 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NDC80O14777 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDC80O14777 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDC80O14777 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC80O14777 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC80O14777 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC80O14777 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms