Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHDO14521 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHDO14521 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHDO14521 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHDO14521 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHDO14521 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHDO14521 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHDO14521 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHDO14521 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHDO14521 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDHDO14521 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHDO14521 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHDO14521 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHDO14521 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHDO14521 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHDO14521 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHDO14521 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHDO14521 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHDO14521 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms