Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLOD2O00469 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLOD2O00469 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms