Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIP1O00291 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIP1O00291 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIP1O00291 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIP1O00291 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIP1O00291 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIP1O00291 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIP1O00291 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIP1O00291 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIP1O00291 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIP1O00291 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIP1O00291 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIP1O00291 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIP1O00291 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIP1O00291 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIP1O00291 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIP1O00291 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIP1O00291 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIP1O00291 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIP1O00291 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIP1O00291 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIP1O00291 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIP1O00291 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIP1O00291 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIP1O00291 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIP1O00291 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIP1O00291 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIP1O00291 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIP1O00291 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIP1O00291 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIP1O00291 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIP1O00291 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIP1O00291 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIP1O00291 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIP1O00291 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIP1O00291 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIP1O00291 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HIP1O00291 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIP1O00291 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIP1O00291 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HIP1O00291 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIP1O00291 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIP1O00291 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIP1O00291 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIP1O00291 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIP1O00291 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIP1O00291 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIP1O00291 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIP1O00291 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HIP1O00291 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIP1O00291 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIP1O00291 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIP1O00291 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIP1O00291 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIP1O00291 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIP1O00291 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms