Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAPO00193 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAPO00193 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAPO00193 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAPO00193 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAPO00193 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAPO00193 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAPO00193 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAPO00193 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAPO00193 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAPO00193 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAPO00193 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAPO00193 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAPO00193 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAPO00193 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAPO00193 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAPO00193 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAPO00193 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAPO00193 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAPO00193 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAPO00193 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAPO00193 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAPO00193 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAPO00193 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAPO00193 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAPO00193 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAPO00193 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAPO00193 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAPO00193 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAPO00193 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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