Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BSA7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSA7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSA7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSA7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BSA7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BSA7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BSA7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSA7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSA7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSA7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BSA7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BSA7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BSA7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BSA7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSA7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSA7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSA7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSA7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BSA7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BSA7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSA7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSA7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSA7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSA7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BSA7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BSA7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BSA7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSA7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSA7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BSA7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BSA7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BSA7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BSA7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BSA7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms