Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF879B4DU55 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF879B4DU55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms