Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCA1A8K7I4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCA1A8K7I4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA1A8K7I4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA1A8K7I4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms