Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPDYE4A6NLX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPDYE4A6NLX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPDYE4A6NLX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms